Paulo Autuori fue entrenador de la Selección Peruana entre los años 2003 y 2005, siendo traído por Manuel Burga por los títulos que ganó con Alianza Lima y Sporting Cristal. Repentinamente renunció a su cargo y no precisamente por malos resultados.
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En el año 2001, Paulo Autuori llegó al Perú para dirigir a Alianza Lima y en el 2002 pasó a las filas de Sporting Cristal, en ambos clubes cumplió las expectativas al haber salido campeón en el fútbol peruano y eso le valió para ser considerado como nuevo técnico de la Selección Peruana.
Su debut con la Selección Peruana fue ante Haití en un amistoso en el Alejandro Villanueva en el que además fue el debut de Jefferson Farfán con los colores patrios. Paulo Autuori debutó con el pie derecho en la bicolor tras el 5-1 en dicho encuentro ante la selección centroamericana.
Sin embargo, luego de 31 partidos el brasileño Paulo Autuori renunció a la Selección Peruana producto de un llamado del Congreso de la República. ¿Cómo así? Un 25 de abril de 2005, hace 17 años, el brasileño renunció al equipo patrio ya que el congresista Víctor Manuel Noriega (APRA) que decidió investigar e interrogar al DT para conocer su sueldo todo a partir de supuestas irregularidades dentro de la Federación Peruana de Fútbol (FPF).
Paulo Autuori aceptó la segunda invitación del Congreso de la República que lo investigaba por ganar un sueldo de 30 mil dólares mensuales, un auto del año y reiterados viajes entre Lima a Río de Janeiro. Pese a asistir a esta cuestionable invitación el brasileño se negó a responder las preguntas y solo dijo: "Tengo derecho a guardar silencio". Luego, el DT brindó una conferencia de prensa para asumir su renuncia y afirmó que dicha citación al Congreso lo "hizo sentir humillado".
Con los años, Paulo Autuori dirigió a diversos equipos y selecciones en toda parte del mundo como Brasil, Qatar, Japón, Colombia y Bielorrusia. Pero su último equipo que dirigió fue Athletico Paranaense en el año 2021. Desde ese momento no dirige más aunque busca también la oportunidad de ser director deportivo.
Paulo Autuori y sus números en la Selección Peruana
Estos fueron los números de Paulo Autuori dirigiendo a la Selección Peruana durante 2003 al 2005:
| Paulo Autuori en la Selección Peruana | Números |
| Partidos Jugados | 31 |
| Partidos Ganados | 9 |
| Partidos Empatados | 10 |
| Partidos Perdidos | 12 |
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