Quedó fuera de la competencia en la Copa Libertadores 2020. Universitario de Deportes cayó por la mínima diferencia ante Cerro Porteño, sin posibilidades de acceder a la fase de grupos del torneo.El triunfo del cuadro paraguayo frenó las aspiraciones del conjunto nacional.
El club crema necesitaba empatar sin goles o marcando una conquista en su visita a Paraguay para forzar tiempo extra o una posible definición de la llave por penales. Francisco Carrizzo anotó para Cerro Porteño en la revancha de la serie, que se inició con un empate 1-1 entre ambos conjuntos en el Monumental de Ate.
A pesar de la derrota, la competitividad del equipo crema a nivel internacional dejó conforme a su DT Gregorio Pérez, quien se pronunció luego de la caída de sus dirigidos en Asunción por la segunda fase eliminatoria del certamen continental y sin embargo, a pesar de la desilusión, el uruguayo se quedó con un balance positivo sobre el rendimiento de sus dirigidos.